文献类型：期刊文章

作　　者：罗皓[1] 梁浩[2] 邵一鸣[3] 张志勇[2] 邢辉[3] 沈菁[2] 卢灿健[4]

机构地区：[1]广东医学院公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室,广东东莞523808 [2]广西医科大学艾滋病研究中心 [3]中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防与控制中心病毒免疫室 [4]广西横县卫生防疫站

出　　处：《实用预防医学》

基　　金：广西科学基金项目(桂科自0447049)

年　　份：2008

卷　　号：15

期　　号：1

起止页码：11-16

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的了解广西HIV-1亚型膜蛋白V3环的氨基酸序列特征及变异特点。方法应用nest-PCR对46份来自广西主要流行区的HIV-1重组毒株env基因区进行扩增后,使用ABI310型测序仪测序,然后应用CLUSTAL、MEGA和dnatools等生物学软件对env基因区V3环及其临近区域的氨基酸序列进行分析。结果46份基因序列,43份为CRF01-AE(93.48%),3份为CRF08-BC(6.52%);V3环氨基酸序列分析显示,CRF01-AE毒株存在7种类型:GPGQ(74.4%)、GPGR(9.3%)、GPGK(4.7%)、GPGH(4.7%)、GPGA(2.3%)、GRGE(2.3%)和RPGE(2.3%),而CRF08-BC毒株V3顶端四肽为GPGQ;根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况,结果显示:60.47%的CRF01-AE重组毒株可能使用CCR5为辅助受体,39.53%不能对辅助受体的使用做出预测,CRF08-BC重组毒株100%可能使用CCR5。结论目前广西HIV-1的主要流行株是CRF01-AE;V3环序列高度变异,顶端四肽主要是GPGQ,可能为NSI型毒株。

关 键 词：人类免疫缺陷病毒Ⅰ型  变异  亚型  

分 类 号：R512.91]