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翻白草总DNA的提取与ISSR-PCR体系的建立与优化
Establishment and Optimization of ISSR-PCR Reaction System and Genome DNA of Discolor cinquefoil Herb
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]湖南大学生命科学与技术研究院生物能源与材料研究中心,湖南长沙410082 [2]怀化学院生物工程系,湖南怀化418008
基 金:国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21006)
年 份:2008
卷 号:36
期 号:3
起止页码:895-897
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2004、CAS、JST、RCCSE、核心刊
摘 要:[目的]针对翻白草ISSR的反应特点,建立稳定可靠的ISSR分子指纹标记反应体系,为进一步研究翻白草的居群差异奠定基础。[方法]通过筛选引物并设定影响翻白草ISSR反应的诸因子的不同浓度,检测ISSR不同反应体系的扩增效果;通过分析非特异性条带的产生原因并进行条件优化,建立翻白草ISSR稳定可靠的反应体系。[结果]首次建立了可用于翻白草ISSR-PCR分析的最适宜的反应体系,确定了25μl PCR反应体系中各试剂终浓度:1×Buffer缓冲液,1U TaqDNA聚合酶,2.5mmol/LMg^2+,0.25mmol/LdNTP,0.4μmol/L引物,DNA模板约20~30ng,退火温度在50~56℃;实验表明:Taq酶质量、DNA模板品质、退火温度、Mg^2+浓度、dNTP浓度均对ISSR反应结果具有较大影响。[结论]所建立的翻白草ISSR反应体系具有标记位点清晰、反应系统稳定、检测多态性能力较强、重复性好等特点,可以较好地应用于翻白草的居群鉴别及居群分子生态的研究。
关 键 词:翻白草 总DNA提取 ISSR—PCR 体系优化
分 类 号:Q503]
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