文献类型：期刊文章

作　　者：谭军[1] 徐勤民[1] 周其兴[2] 薛庆中[3]

机构地区：[1]重庆邮电大学生物信息研究所,重庆400065 [2]大连大学生物工程学院,辽宁大连116622 [3]浙江大学农业与生物技术学院,杭州310039

出　　处：《重庆工商大学学报（自然科学版）》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(3030021);重庆市自然科学基金资助项目(2005BB5053)

年　　份：2007

卷　　号：24

期　　号：1

起止页码：16-21

语　　种：中文

收录情况：JST、普通刊

摘　　要：从公布的水稻两个亚种(籼稻9311和粳稻Nipponbare)基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异:内含子和基因间区中微卫星的多态性较高(分别约为45%和40%),外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低(约为25%);两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。

关 键 词：水稻亚种 基因组 微卫星 多态性 分子进化

分 类 号：S530]