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期刊文章详细信息

GeneSifter在基因表达谱芯片数据挖掘中的应用    

Application of GeneSifter Software for Data Mining of Gene Expression Profiling

  

文献类型:期刊文章

作  者:廖之君[1] 马文丽[1] 梁爽[1] 郑文岭[2]

机构地区:[1]南方医科大学基因工程研究所 [2]华南基因组研究中心,广东广州510800

出  处:《医学信息(西安上半月)》

基  金:广东省重点实验室基金资助

年  份:2007

卷  号:20

期  号:11

起止页码:1882-1887

语  种:中文

收录情况:普通刊

摘  要:介绍一款基因芯片数据分析工具──GeneSifter软件,具有快速、直观、便捷等特点,尤其适用于基因表达谱的数据挖掘。芯片数据一般以格式化文本文档形式上载,根据实验目的、设计不同,总共有4种上载向导工具,数据分析从控制台Analysis项目下的Pairwise或Projects进入,需要设置滤过、阈值和统计分析等参数,Pairwise可获得的结果有:差异显著性基因列表、基因本体报告和KEGG通路报告等,Projects有更为强大的功能,可获取聚类等6种结果。GeneSifter独特的一站式单击设置,可获得相关基因的11个数据库最新链接。GeneSifter适用于基因芯片数据挖掘的生物研究人员。

关 键 词:GeneSifter软件  数据挖掘 基因本体术语  KEGG通路  聚类

分 类 号:R512.63]

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同被引文献:

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