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6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析
Sequence analysis of mitochondrial COI gene fragment of six Veneridae clams(Mollusca:Bivalvia) and four populations of Meretrix meretrix
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]淮海工学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室,江苏连云港222005 [2]中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,江苏无锡214081 [3]南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡214081 [4]江苏省海洋水产研究所,江苏南通226007
基 金:"十五"国家科技攻关计划专题项目(2004BA526B0403);淮海工学院自然科学基金项目(Z2004034);江苏省海洋生物技术重点实验开放基金项目(2006HS001);淮海工学院引进人才科研启动基金项目(KK03035)资助
年 份:2007
卷 号:29
期 号:5
起止页码:109-116
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、INSPEC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:对文蛤(Meretrix meretrix L.,1758)、青蛤(Cyclina sinensis G.,1791)、硬壳蛤(Mercenaria mercenaria L.,1758)、江户布目蛤(Protothaca jedoensis L.,1874)、薄片镜蛤(Dosinia corrugata R.,1850)和菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum A.,1850)6种帘蛤科贝类和4个地理种群文蛤(大连、连云港、湛江、防城港)的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段的核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、种群遗传结构和分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为709 bp,序列A+T含量(62.2%-67.6%)明显高于GC含量.物种间共有变异位点311个,其中简约信息位点202个;文蛤4个地理种群间共有变异位点46个,其中简约信息位点2个.此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点85个;文蛤种群间只有1个氨基酸变异位点.以COⅠ基因片段序列为标记,用大竹蛏(Solen grandis)作外群,构建了帘蛤科贝类的系统发生树,其拓扑结构显示4个地理种群文蛤首先聚为1个单元,然后与青蛤聚在一起,最后所有帘蛤科物种聚为一枝,与外群相区别,其结果与传统形态分类基本一致,说明COⅠ基因适合作为该科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记.
关 键 词:帘蛤科 线粒体DNA 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ 系统发生学 系统发生生物地理学
分 类 号:S917.4[水产类]
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