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基于启发式算法和支持向量机算法预测醛类化合物急性毒性 ( EI收录 SCI收录)
Quantitative Structure Activity Relationship Models for the Prediction of Rat Lethal Dose 50% of Aldehydes Based on Heuristic Method and Support Vector Machine
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]浙江大学计算机学院,杭州310027 [2]青岛大学计算科学与工程技术研究中心
基 金:国家自然科学基金(No.60475025);教育部博士点基金(No.20050335096);广东省科技计划(No.2003C101025)资助项目
年 份:2007
卷 号:35
期 号:9
起止页码:1263-1268
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、EI、IC、JST、RCCSE、RSC、SCI(收录号:WOS:000251296200005)、SCI-EXPANDED(收录号:WOS:000251296200005)、SCIE、SCOPUS、UPD、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:应用启发式算法(HM)和支持向量机算法(SVM)建立了88种醛类化合物对大鼠急性毒性的定量构效关系模型。应用ChemOffice2004软件进行化合物的结构输入,利用半经验方法进行分子结构优化,在CODDESA软件中计算出组成、拓扑、几何、电子和量子化学参数。并用启发式方法筛选出相对阳性电荷、氧原子数量、碳原子的最小亲核反应指数、双键相对数量、碳原子数量、碳氢键之间的最大交换能量、最大σ-σ键序和双键数量8个参数,在此基础上应该多元线性回归和支持向量机方法建立QSPR模型。两种方法均得到了较好的结果,HM和SVM的交互检验的相关系数分别为0.90和0.93;通过对模型的稳定性和预测能力比较,SVM建立的QSAR模型能够更好地预测醛类化合物对大鼠急性毒性LD50。
关 键 词:定量构效关系 醛 急性毒性 支持向量机 启发式算法
分 类 号:R114]
参考文献:
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