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罗非鱼海豚链球菌16S rRNA基因的序列测定和系统进化分析
Sequencing and phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene of Streptococcus iniae
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广西水产研究所,广西南宁530021 [2]广西大学动物科学技术学院,广西南宁530005
基 金:广西科学研究与技术开发计划基金资助项目(0639036)
年 份:2007
卷 号:31
期 号:5
起止页码:618-623
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:为了从分子水平上对1株致病性罗非鱼链球菌进行分类学鉴定,利用原核生物16SrRNA基因通用引物对分离纯化的罗非鱼致病性链球菌进行16S rRNA基因的克隆及序列分析。结果扩增出长约1.5 kp目的片段,测序得到1条长度为1 447 bp核苷酸序列。核苷酸相似性分析表明,序列与NCB I公布的海豚链球菌(Streptococcus iniae,S.iniae)SCCF5L菌株16SrRNA基因核苷酸序列相似性最高(99.4%),暂称为中国广西株(S.iniae-CGX)。同时,亲源关系较近的S.iniae、S.difficilis和S.agalactiae代表菌株构建的系统发育进化树显示,所得菌株与S.iniae代表菌株组成同一进化分支,与S.agalactiae代表菌株组成的另一进化分支距离较近(95.5%),而与S.difficilis代表菌株组成的进化分支距离较远(92.3%)。上述研究证实,本试验从发病罗非鱼脑组织分离到的致病性链球菌为海豚链球菌。
关 键 词:罗非鱼 海豚链球菌 16S RRNA 克隆 系统发育进化树
分 类 号:S917[水产类]
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