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期刊文章详细信息

用于基因数据挖掘的基因表达数据库GEO    

Data Mining Procedures Using GEO(Gene Expression Omnibus)

  

文献类型:期刊文章

作  者:余海浪[1] 马文丽[1] 郑文岭[1]

机构地区:[1]南方医科大学基因工程研究所,广州510515

出  处:《中国生物工程杂志》

年  份:2007

卷  号:27

期  号:8

起止页码:96-103

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:使用高通量方法学来检测基因表达情况在最近几年已非常普遍。微集芯片技术可同时定量成千上万的基因转录本。基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus简称GEO)是目前最大的而且完全公开的高通量分子丰度数据库,主要储存基因表达数据。该数据库以一个灵活开放的设计理念,允许用户或科研人员来递呈,保存和检索多种不同类型的数据。综述了近年来该数据库在基因表达数据挖掘中的应用,同时介绍一些通过使用用户友好网络界面能有效探索、查询和再现数百个实验和数百万个基因表达谱的工具,以方便数据进行挖掘和可视化。登录GEO公用数据库的网址为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo。

关 键 词:GEO DNA微阵列 基因表达 数据挖掘

分 类 号:Q819[生物工程类]

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同被引文献:

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