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期刊文章详细信息

藏绵羊GHR基因5′侧翼区序列特征分析    

Sequence characterization of the 5'-Flanking region of the GHR gene in Tibetan sheep

  

文献类型:期刊文章

作  者:马志杰[1] 魏雅萍[1] 钟金城[2] 陈智华[2] 卢虹[2] 童子保[1]

机构地区:[1]青海省畜牧兽医科学院畜牧研究所,西宁810016 [2]西南民族大学生命科学与技术学院,成都610041

出  处:《遗传》

基  金:青海省基础研究与软科学计划项目资助(编号:2006-Z-601)~~

年  份:2007

卷  号:29

期  号:8

起止页码:963-971

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:对欧拉型藏绵羊生长激素受体(GHR)基因5′侧翼区(包括P1启动子和外显子1A)进行了T-A克隆和序列测定(GenBank accession No.EF116490),在分析其序列结构特征的基础上与GenBank中摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛进行了比较基因组学和系统进化研究,结果表明:(1)欧拉型藏绵羊GHR基因启动子P1区存在C/EBP、C/EBPb、SP1、Cap、USF、HFH-2、HNF-3b、Oct-1等多个潜在的转录因子结合位点,可能与GHR基因的转录调控和起始以及特异表达有关。在该非编码序列中,重复序列所占比率为2.55%,不存在SINEs、LINEs、LTR类反转录元件和DNA转座子元件,而发现存在一(TG)11微卫星位点;(2)在启动子P1区,藏绵羊与摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛各物种间同源性大小分别为99.7%、94.2%、85.9%、86.5%;而在外显子1A区段,藏绵羊与摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛各物种间同源性大小分别为99.0%、97.0%、92.7%、94.6%。物种间欧拉型藏绵羊与摩弗伦羊同源性最高,而欧拉型藏绵羊与普通牛最低。(3)邻接法(即NJ法)构建的分子系统进化树聚类结果表明,欧拉型藏绵羊与摩弗伦羊先聚为一类,再与山羊聚类形成一个大分支,而普通牛和欧洲野牛先聚类形成另一大分支,两大分支最后再聚为一起,其聚类结果与线粒体DNA和动物学分类的研究结果一致。

关 键 词:欧拉型藏绵羊  GHR基因 克隆 微卫星 启动子

分 类 号:S826]

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