文献类型：期刊文章

作　　者：罗皓[1] 梁浩[2] 邵一鸣[3] 张志勇[2] 邢辉[3] 沈菁[2] 卢灿健[4]

机构地区：[1]广东医学院公共卫生学院,东莞523808 [2]广西医科大学艾滋病研究中心 [3]中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防与控制中心病毒免疫室 [4]广西横县卫生防疫站

出　　处：《现代预防医学》

基　　金：广西科学基金项目(桂科自0447049)

年　　份：2007

卷　　号：34

期　　号：16

起止页码：3028-3031

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、IC、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：[目的]分析广西HIV-1重组流行株env基因V3-V4区及其临近区域的基因变异。[方法]应用nest-PCR对24份来自广西主要流行区的HIV-1重组毒株env基因区进行扩增后,使用ABI310型测序仪测序,然后应用CLUSTAL、MEGA和dnatools等生物学软件对env基因区V3-V4区及其临近区域进行序列分析。[结果]24份毒株中21份为CRF01-AE(93.48%),3份为CRF08-BC(6.52%);系统树分析显示,21份与分离于广西地区的CRF01-AE.97CNGX2f和泰国代表毒株THCM240接近,3份CRF08-BC重组毒株中有2份与CRF08-BC.98CN006和CRF08-BC.97CNGX6f靠近,还有1份样本则接近C.95IN21068;env基因V3-V4区核苷酸序列分析显示,广西的样本与分离于该地区的代表毒株基因距离较小,CRF01-AE和CRF08-BC重组毒株的氨基酸替换主要发生在C3和V4区,而V3区氨基酸序列相对保守。[结论]CRF01-AE重组毒株env基因V3-V4区的变异主要发生在C3和V4区,而不是V3区。

关 键 词：人类免疫缺陷病毒1型 基因变异  序列分析  

分 类 号：Q319.1]