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番木瓜棕榈疫霉核糖体DNA-ITS序列分析
Sequence analysis of the ribosomal DNA ITS of Phytophthora palmivora on Carica papaya
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]福建省农科院植物保护研究所,福建福州350013 [2]仲恺农业技术学院植物病理研究所,广东广州510225
基 金:广东省自然科学基金(5002883)资助项目
年 份:2007
卷 号:20
期 号:2
起止页码:7-12
语 种:中文
收录情况:CAS、普通刊
摘 要:采用真菌核糖体转录间隔区通用引物ITS1和ITS4,PCR扩增了2株分离自广州的番木瓜疫霉菌(Phytoph-thorasp.)的核糖体基因ITS序列,并对PCR产物进行了克隆测序.供试菌株C0506071、C0506072分别克隆出814 bp、830 bp的序列,两菌株ITS序列间的相似同源率为99.62%.将供试菌株的ITS序列与GenBank中登陆的20株疫霉菌株的ITS序列进行聚类分析,结果表明,供试菌株与GenBank注册的AF467093、AJ517463聚在同一分枝上,均为棕榈疫霉(Phytophthora palmivora),其他不同的疫霉种聚在不同的分支上,系统学关系较远.这表明分离自广州的2株番木瓜疫霉菌为棕榈疫霉(Phytophthora palmivora).
关 键 词:番木瓜 棕榈疫霉 核糖体DNA-ITS
分 类 号:Q93-331]
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