文献类型：期刊文章

作　　者：庞建新[1] 黄江[2] 胡旭初[3] 徐劲[3] 余新炳[3] 包怀恩[2] 郎书源[2]

机构地区：[1]南方医科大学药学院新药评价中心,广州510515 [2]贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳550004 [3]中山大学中山医学院寄生虫学教研室,广州510080

出　　处：《热带医学杂志》

基　　金：贵州省科技攻关项目[黔科合NY字(2006)3037]

年　　份：2007

卷　　号：7

期　　号：6

起止页码：513-515

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、RCCSE、UPD、WOS、ZGKJHX、ZR、普通刊

摘　　要：目的分析和预测亚洲带绦虫成虫延伸因子-1(elongation factor 1,EF-1)基因及其编码的蛋白的结构和功能。方法利用生物信息网站如美国国家生物技术信息中心(NCBI,http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http:∥ca.expasy.org/)中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具,结合其它生物信息学分析软件包,从亚洲带绦虫成虫全长cDNA质粒文库中识别延伸因子-1的全长编码基因并预测其蛋白的结构和功能。结果该基因是全长基因,长度988bp,编码区为67～868,编码269个氨基酸,无跨膜区;与GenBank中细粒棘球绦虫同源基因的一致性达87%,相似性达91%;预测三个主要的抗原表位位于135～140,126～131,157～162。结论应用生物信息方法从亚洲带绦虫成虫cDNA文库中筛选出EF-1基因。

关 键 词：亚洲带绦虫 延伸因子-1  CDNA 生物信息学

分 类 号：R383.32]