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长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究
Molecular Clone and Sequencing Analysis on Pseudogenized Copy of nrDNA ITS Region in Nothotsuga longibracteata
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,北京100093 [2]安徽师范大学生命科学学院生物大分子进化重点实验室,安徽芜湖241000
基 金:国家自然科学基金(30400023);国家自然科学基金(30500300);教育部科学技术研究重点项目(206066);安徽省引进海外留学人才基金(2005Z032)
年 份:2007
卷 号:16
期 号:2
起止页码:208-215
语 种:中文
收录情况:AJ、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、ZGKJHX、普通刊
摘 要:NrDNA作为一个重要的工具,在许多分类等级上被广泛地应用于系统发育的分析。以长苞铁杉(Nothotsuga longibracteata)为实验材料,通过nrDNA ITS区特异拷贝的克隆及假基因化分析,在序列水平上探讨假基因化的特征,进而探讨引起多拷贝基因家族假基因化的分子机制。实验结果表明:假基因化拷贝的序列长度为1 745 bp,比其它拷贝短11 bp-12 bp;GC含量明显偏低,特别是5.8 S区和ITS2区的GC含量分别比其它克隆低6.15%-6.17%和5.75%-6.15%;5.8 S区和ITS2区序列变异大,遗传距离(d)分别为0.0718+0.0221和0.0691+0.0178;在系统发育的分析中出现异常的长枝现象。
关 键 词:长苞铁杉 核RDNA 假基因 克隆 序列分析
分 类 号:Q349.55] Q949.66
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