文献类型：期刊文章

作　　者：罗皓[1] 梁浩[1] 邵一鸣[2] 张志勇[1] 邢辉[2] 刘伟[3] 卢灿健[4] 沈菁[1]

机构地区：[1]广西医科大学艾滋病研究中心 [2]中国疾病顶防控制中心性病艾滋病预防与控制中心病毒免疫室 [3]广西壮族自治区疾病预防控制中心 [4]广西横县卫生防疫站

出　　处：《中国公共卫生》

基　　金：广西白然科学基余项日(桂科自0447049)

年　　份：2007

卷　　号：23

期　　号：4

起止页码：450-452

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的建立一种简便、快速基因分型方法,对广西人类免疫缺陷病毒(HIV-1)重组毒株gag基因区进行亚型鉴定。方法从HIV阳性样本中提取核酸,使用HIV-1 M组通用引物对gag区进行第1轮扩增,第2轮使用分别检测C亚型和CRF01-AE重组型的二套特异性引物放入同一反应管中进行扩增,根据不同亚型扩增的目的带位置不同判断亚型。另外设计了一套引物,专门用于检测B’/C重组毒株。扩增出的所有样本均进行基因测序和系统树分析以验证结果。结果54份样本中,经基因测序和系统树分析证实CRF08-BC样本4份(7.41%),CRF01-AE样本46份(85.18%),4份(7.41)无法确定亚型。经亚型特异性引物PCR法检测出4份(100%)B’/C重组毒株,45份(97.83%)CRF01-AE重组毒株,灵敏度为98%,特异性为100%。2种方法检测结果经差异性检验显示,P>0.05,差异无统计学意义,结果一致性高达98.15%。与基因分析结果吻合。重复实验显示,B’/C的平均重复性为100%(20/20),CRF01-AE为98.3%(59/60)。结论该方法具有简便、快速,高度灵敏度和特异性的特点,可直接对广西HIV-1重组毒株CRFO 1-AE gag基因区进行分型。

关 键 词：人类免疫缺陷病毒1型 基因型 聚合酶链反应

分 类 号：R181.23]