文献类型：期刊文章

作　　者：卢雯静[1] 刘银坤[1] 孙强玲[1] 周海军[1] 周新文[2] 郭坤[1] 陆豪杰[2] 杨芃原[2]

机构地区：[1]复旦大学附属中山医院肝癌研究所,上海200032 [2]复旦大学化学系蛋白质组学研究中心,上海200433

出　　处：《复旦学报（医学版）》

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973项目)(001CB510205;2004CB520802);国家高技术研究发展计划(863项目)(2002BA711A11)

年　　份：2007

卷　　号：34

期　　号：1

起止页码：29-36

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的分析健康人肝组织麦胚凝集素(wheatgermagglutinin,WGA)亲和型糖蛋白表达谱。方法从30例健康人肝组织混合样本的总蛋白中用WGA凝集素亲和层析分离纯化糖蛋白,再利用双向电泳结合SYPRO Ruby荧光染色进一步分离WGA亲和型糖蛋白。目的蛋白质点经质谱鉴定后对其进行生物信息学分析及功能分类。结果初步建立WGA亲和型糖蛋白的双向电泳图谱,图谱均点数为(650±50)个,质谱鉴定并去冗余共获116个蛋白。经生物信息学分析104个蛋白具有不同程度的N糖基化位点,最后按Gene Ontology的分类原则进行功能分类。结论凝集素亲和层析结合双向电泳荧光染色、质谱鉴定是一种高通量的检测方法,WGA亲和型糖蛋白表达谱的初步构建为后续研究奠定了基础。

关 键 词：凝集素亲和层析  双向电泳 SYPRO  Ruby荧光染色  质谱  生物信息学  

分 类 号：TQ936.223]