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期刊文章详细信息

苎麻基因组微卫星的分离与鉴定(英文)    

Isolation and Characterization of Microsatellites from Ramie [Boehmeria nivea (L.) Gaud.]

  

文献类型:期刊文章

作  者:蒋彦波[1] 揭雨成[1] 周建林[2] 邢虎成[1] 佘玮[1]

机构地区:[1]中国农业科学院麻类研究所,湖南长沙410205 [2]湖南师范大学生命科学院生物化学与分子生物学系,湖南长沙410081

出  处:《作物学报》

基  金:National Natural Science Foundation of China(30270849),High-Tech Research and Development Program of China (2001AA241211) and Hunan Provincial Natural Science Foundation (04JJ3016)

年  份:2007

卷  号:33

期  号:1

起止页码:158-162

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经Mse Ⅰ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得了双链目的片段,回收300—1000bp DNA片段,然后克隆到pMD18-T载体上,转化至DH5α中,这样就构建了苎麻富含(GA)n微卫星的部分基因组文库。随机挑取36个克隆,以锚定简单重复序列为引物对其进行PCR筛选。测序分析了22个阳性克隆,每个克隆都含有微卫星DNA,阳性克隆率为61.1%,微卫星种类以与探针互补的(GA/CT)n为主,占83.3%,同时还存在(TG/AC)n和三碱基、六碱基为单元构成的苎麻微卫星,如(GAC)n、(ACG)n、(TCT)n、(TCG)n、(GAA)n、(CCGACG)n、(GAGAAA)n等。最后以18个微卫星位点设计了18对苎麻微卫星特异引物。GMCT重复单元的长度从7到40范围内变化,平均为19.2,显示了它们将产生良好多态性,为一种强有力的遗传标记。苎麻微卫星DNA标记可广泛应用于苎麻基因型鉴定,基因和QTL分析,分子标记辅助育种,系谱分析等。

关 键 词:苎麻[Boehmeria  nivea(L.)Gaud]  微卫星 磁珠 基因组文库 (CA)n重复序列  

分 类 号:S563.1]

参考文献:

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同被引文献:

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