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期刊文章详细信息

五指山猪IGF2基因5'调控区单核苷酸多态性分析    

Single nucleotide polymorphism analysis on the 5' regulatory region of IGF2 gene in Wuzhishan pig

  

文献类型:期刊文章

作  者:常怀普[1] 欧江涛[2] 钟金城[1] 王希龙[2] 郭春华[1] 宾石玉[3] 马志杰[4]

机构地区:[1]西南民族大学生命科学与技术学院,成都610041 [2]海南省农业科学院畜牧兽医研究所 [3]广西师范大学,桂林541004 [4]青海省畜牧兽医科学院畜牧研究所,西宁810016

出  处:《遗传》

基  金:国家高技术研究发展计划项目(国家863计划)(编号:2004AA213112)资助~~

年  份:2007

卷  号:29

期  号:1

起止页码:57-64

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、梅山猪和大白猪共60个样本的IGF2基因5'调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究。找到13个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A5976G、C6010T、T6029A、C6037T、C6043T、C6063T、C6112T、C6164T、G13520A、G13563A和G13669A。T6029A为T←→A碱基颠换,A5976G、G13520A、G13563A和G13669A为A←→G转换,其他均为C←→T转换。针对13个SNP位点得到23种组合基因型。统计各位点等位基因和基因型以及各组合基因型在总群体与各品种内的分布频率,发现3个小型猪在A5976G、C6164T和G13669A位点上的优势等位基因均分别为G、T和A,而梅山猪和大白猪的优势等位基因均分别为A、C和G;H19型为3个小型猪的特征组合基因型,而另两个猪品种为H15型。同时对123头五指山猪IGF2基因C5888T位点进行了PCR-RFLP分析,研究表明该位点C为优势等位基因(0.8536),CC为优势基因型(0.7235)。卡方检验表明该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。这些结果可为五指山猪等小型猪的生长发育规律、矮小机制等方面的研究提供遗传学依据。

关 键 词:五指山猪 IGF2基因 SNP PCR—RFLP  

分 类 号:S828]

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