文献类型：期刊文章

作　　者：陈薇[1] 谭军[1] 何晨[1]

机构地区：[1]重庆邮电大学生物信息学院生物信息研究所,重庆400065

出　　处：《重庆邮电学院学报（自然科学版）》

基　　金：重庆市科委自然科学基金项目(2005BB5053)

年　　份：2006

卷　　号：18

期　　号：6

起止页码：803-808

语　　种：中文

收录情况：CSA、CSA-PROQEUST、IC、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：miRNAs前体(pre-miRNAs)是产生成熟miRNAs的基因表达产物,能形成较为稳定的发卡环结构,具有较低的最小折叠自由能(minimal folding free energy,MFE)。在对植物pre-miRNAs长度、不同碱基含量、MFE、熵分析基础上,重点比较不同RNAs序列之间MFE与其长度的比值(MFEL)。结果表明MFEL是区分植物pre-miR-NAs的一个很有效的参数:pre-miRNAs的MFEL值平均为-45.98 kcal/mol,明显低于mRNAs(-23.08 kcal/mol),tRNAs(-22.13 kcal/mol)和rRNAs(-16.83 kcal/mol)。使用MFEL参数可提高预测植物miRNAs基因的效率。

关 键 词：拟南芥 MIRNAS 最小自由能  长度  熵  

分 类 号：Q754]