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期刊文章详细信息

云南省丙型肝炎病毒基因型及3b型遗传进化树分析    

Hepatitis C virus genotype in Yunnan and phylogenetic tree analysis

  

文献类型:期刊文章

作  者:李峥[1] 高玉红[1] 毕胜[1] 杨曦[1] 张桂前[1] 台虹[1]

机构地区:[1]云南省临床检验中心,昆明650032

出  处:《国际检验医学杂志》

年  份:2006

卷  号:27

期  号:11

起止页码:979-980

语  种:中文

收录情况:CAS、CSA、CSA-PROQEUST、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘  要:目的 了解云南省丙型肝炎患者HCV基因型分布。对3b型进行遗传进化树分析。方法 应用丙型肝炎非编码区ABC程序酶切分型法对云南省46例HCVRNA阳性血清标本进行HCV基因分型研究。从根据5′端非编码区(5′NCR)ABC分型结果判断为3b基因型10例标本中随机选择2例(A18、A32)进行HCV5′NCRcDNA双向测序。结果 通过46例HCV5′NCRRNA阳性标本分型研究.云南省HCV感染基因型依次为1b型、3b型、3a、1a和2b型、2a/2b等混合型.各型所占比例分别为34.78%、21.74%,10.88%、6.52%、17.39%。2例(A18、A32)3b型进行HCV5′NCR cDNA双向测序,根据测序结果进行基因进化树分析,云南省HCV3b型与GenBank号中国HCV5′NCR 3b株的同源性为99%~100%。结论 云南省HCV主要流行基因型为1b型,其次为3b型;应用5′NCRABC分型法可得到准确分型结果。

关 键 词:肝炎病毒 基因型 序列分析  

分 类 号:R512.63]

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