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期刊文章详细信息

16S rDNA用作荧光定量PCR靶基因快速检测铜绿假单胞菌    

Rapid Detection of Pseudomonas aeruginosa by the Fluorescence Quantitative PCR Assay Targetting 16S rDNA

  

文献类型:期刊文章

作  者:薛利军[1] 王永智[1] 任浩[1] 童一民[1] 赵平[1] 朱诗应[1] 戚中田[1]

机构地区:[1]第二军医大学微生物学教研室,全军医学微生物学重点实验室,上海200433

出  处:《生物工程学报》

基  金:军队"十一五"医学专项课题资助(No.06Z026)。~~

年  份:2006

卷  号:22

期  号:5

起止页码:789-794

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:对20余种细菌16SrDNAs进行多序列比对与进化树分析,设计铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa,PA)荧光定量PCR(fluorescencequantitativePCR,FQ-PCR)特异性引物。提取PA基因组DNA,以特异性引物扩增16SrDNA靶片段,并构建重组质粒pMDT-Pfr。将梯度稀释的pMDT-Pfr质粒作为模板,用于建立定量标准曲线。以SYBRGreenI荧光染料建立20μL反应体系,对不同浓度的PADNA样品进行FQ-PCR检测。同时,以金黄色葡萄球菌、伤寒杆菌、福氏志贺菌、变形杆菌、表皮葡萄球菌、大肠杆菌和结核杆菌的基因组DNA作阴性对照,验证FQ-PCR方法检测PA的特异性。结果显示,设计的FQ-PCR引物的靶向序列,仅对PA16SrDNA有高度同源性;FQ-PCR方法检测PA,其灵敏度达3.6pg/μL的基因组DNA或(2.1×103±3.1×102)拷贝/μL的16SrDNA基因,并且具有很强的特异性;从细菌DNA提取到FQ-PCR检测,可在2h左右完成PA鉴定。较传统的培养鉴定法而言,以16SrDNA作为FQ-PCR靶基因快速检测PA,具有很好的研究价值与应用前景。

关 键 词:铜绿假单胞菌 16S  RDNA 荧光定量PCR 检测  

分 类 号:R450] Q789[临床医学类]

参考文献:

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同被引文献:

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