期刊文章详细信息
兔出血症病毒(RHDV)WHNRH株的分离鉴定及基因组全序列的测定与分析
Isolation,identification and genome sequenceing of a Rabbit hemorrhagic disease virus strain WHNRH
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]四川农业大学动物科技学院动物预防医学生物工程实验室,雅安625014
年 份:2006
卷 号:46
期 号:5
起止页码:720-725
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:从发病长毛兔中分离鉴定了兔病毒性出血症病毒WHNRH株。参考GenBank中已登录的RHDV毒株序列对RHDV WHNRH分离株进行了全基因组序列测定与分析。设计5对扩增区段相互重叠的RHDV特异性引物,扩增除5’和3’末端以外的序列,采用设计锚引物的5’RACE方法以及针对RHDV 3’末端的polyA结构设计引物获得了RHDV WHNRH株的5’和3’末端序列。胶回收各PCR产物,连接pMD18-T克隆载体,测得RHDV WHNRH分离株的基因组全长为7437nt(不包括polyA),与GenBank公布的全部共6株RHDV全基因序列进行同源性比较分析,同源性在89.0%~97.1%之间,ORF1同源性为89.0%~97.1%,编码氨基酸序列的同源性为95.2%~98.7%;ORF2的核酸苷序列同源性为92.1%~97.7%,编码氨基酸序列的同源性为94.1%~96.6%。
关 键 词:分离鉴定 兔出血症病毒 全基因组测序 WHNRH
分 类 号:S852.65]
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