文献类型：期刊文章

作　　者：忻雅[1] 崔海瑞[1] 卢美贞[1] 姚艳玲[1] 金基强[1] 林容杓[2] 崔水莲[2]

机构地区：[1]浙江大学农业与生物技术学院原子核农业科学研究所 [2]忠南大学园艺系

出　　处：《园艺学报》

基　　金：韩国科学技术厅资助项目(98-0402-0601-5)

年　　份：2006

卷　　号：33

期　　号：3

起止页码：549-554

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SSR的近83%;其它重复类型所占比例均不足5%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的71·5%和37·5%。设计了15对EST-SSR引物,在合适的PCR反应体系下,以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物。进一步用这些可扩增的引物对28个白菜品种进行PCR扩增,发现7对引物显示多态性,占引物总数的46·7%。此结果表明,根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。

关 键 词：白菜 EST SSR信息  标记  

分 类 号：S634.3]