期刊文章详细信息
基于PCR-DGGE指纹的南海海绵共附生细菌优势种群的揭示与系统发育分析
Revelation and phylogenetic analysis of the predominant bacterial community associated with sponges in the South China Sea based on PCR-DGGE fingerprints
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]上海交通大学生命科学技术学院海洋生物技术实验室,上海200240
基 金:国家"863计划"(2002AA628080;2004AA628060);上海市青年科技启明星计划(04QMX1411)~~
年 份:2006
卷 号:46
期 号:3
起止页码:487-491
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:采用PCR-DGGE指纹、克隆测序和系统发育分析技术较系统地对我国南海贪婪倔海绵(Dysidea avara)和澳大利亚厚皮海绵(Craniella australiensis)共附生的优势细菌进行了研究。研究发现变形菌门(Proteobacteria)细菌是这两种海绵中的主要优势细菌,贪婪倔海绵中的变形菌包含了α、β、γ三种类型,而澳大利亚厚皮海绵中仅有γ一种类型。两种海绵都有拟杆菌(Bacteroidetes),但是具体的种类不同。这些细菌都是第一次在海绵中被发现。澳大利亚厚皮海绵共附生的优势细菌还包括放线菌属(Actinobacterium)及厚壁菌门(Firmicutes)细菌,菌群多样性要比贪婪倔海绵的丰富。两种海绵尽管来自于同一海域但其共附生优势细菌的组成明显不同,这说明海绵共附生微生物具有宿主特异性。
关 键 词:海绵其附牛细菌 16S RDNA PCR-DGGE指纹 系统发育分析
分 类 号:Q958.122.3] Q938
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