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滇南小耳猪与巴马小型猪SLA-DQA基因多态分析
Studies on the Polymorphism of SLA-DQA Gene between Diannan Small-ear Pig and Bama Pig
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]佛山大学动科系,南海528231 [2]四川农业大学动物科技学院,雅安625014
基 金:国家自然科学基金项目(30300246)资助
年 份:2006
卷 号:37
期 号:5
起止页码:430-435
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:对滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA基因的部分内含子1、完整的外显子2和部分内含子2共341bp片段进行了PCR-RFLP酶切分型,结果表明:2品种经EcoRⅠ酶切后BB基因型频率(0.468 8)高于AB型(0.375 0),AA型最低(0.156 3),B为优势基因(0.656 3),A为劣势基因(0.343 7)。经AluⅠ酶切后,滇南小耳猪MM基因型频率(0.500 0)高于MN型(0.321 4)和NN型(0.178 6);而巴马猪则以MN基因型频率(0.485 3)高于MM型(0.338 2)和NN型(0.176 5);2个品种中M等位基因(0.604 2)频率高于N等位基因(0.395 8)。经分析表明,2猪种在两酶切位点上各分型已达Hardy-Weinberg平衡。巴马小型猪和滇南小耳猪中分别存在9种和7种PCR-RFLP组合基因型,其中BBMN为优势组合基因型,AAMN为劣势组合基因型;AAMM组合基因型在2品种间差异显著(P<0.05)。遗传多态参数分析表明:SLA-DQA基因外显子2的两酶切位点在2猪种间均表现为中度多态,AluⅠ的基因多样性略高于EcoRⅠ,巴马小型猪杂合性略高于滇南小耳猪,2品种间遗传距离为0.000 4。
关 键 词:小型猪 SLA-DQA基因 PCR-RFLP 基因多态
分 类 号:S828.2]
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