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高盐极端环境土壤基因组DNA的分离纯化方法研究及基因文库的构建
Evaluation and optimization of DNA extraction and purification from hypersaline environmental samples and construction of metagenomic library
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室
基 金:国家863计划资助项目(2001AA214141)
年 份:2006
卷 号:25
期 号:1
起止页码:24-29
语 种:中文
收录情况:AJ、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2011_2012、ZGKJHX、ZR、普通刊
摘 要:以钦州市犀牛角镇晒盐池内(盐浓度〉25%)的土壤样品为研究对象,对土壤混合基因组DNA的提取和纯化方法进行了深入研究,结果表明。冻融法、十二烷基磺酸钠(SDS)和蛋白酶K联合使用的提取法,能有效提高DNA得率,DNA的产量达到每克土壤样品10~15μg。交联聚乙烯吡咯烷酮(PVPP)、SeDhadex G-200树脂以及大量胶回收的使用,可有效纯化DNA。纯化的DNA产量可达每克土壤样品4~6μg,DNA片段大小〉30kb,将纯化的DNA用BamH Ⅰ部分酶切后构建以pLAFR3为载体的混合基因组文库,该文库包含15600个克隆,外源片段DNA平均大小为18kb。通过DNA序列测定和同源性比较,对从文库中随机挑取的10个克隆进行了序列分析,发现9个外源插入片段包含未知DNA序列。
关 键 词:土壤 DNA提取 DNA纯化 混合基因组DNA文库
分 类 号:S154.3]
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