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期刊文章详细信息

茶树EST-SSR的信息分析与标记建立    

Data Mining for SSRs in ESTs and Development of EST-SSR Marker in Tea Plant (Camellia sinensis)

  

文献类型:期刊文章

作  者:金基强[1] 崔海瑞[1] 陈文岳[2] 卢美贞[1] 姚艳玲[1] 忻雅[2] 龚晓春[1]

机构地区:[1]浙江大学原子核农业科学研究所,浙江杭州310029 [2]杭州市农业科学院,浙江杭州310024

出  处:《茶叶科学》

年  份:2006

卷  号:26

期  号:1

起止页码:17-23

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、FSTA、JST、RCCSE、RSC、ZGKJHX、核心刊

摘  要:在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系。以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%。本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的。

关 键 词:茶树 EST SSR信息  标记建立  

分 类 号:S571.1] Q523]

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