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水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位
SCAR Markers and Preliminary Gene Mapping of a Dominant Semi-dwarf Mutant in Rice
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国科学院安徽省离子束生物工程学重点实验室,安徽合肥230031 [2]安徽省农业科学院水稻研究所,安徽合肥230031 [3]上海市农业科学院作物所,上海201106
基 金:国家自然科学基金(3037863);安徽省自然科学基金(01041103)资助项目
年 份:2006
卷 号:32
期 号:3
起止页码:449-454
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:粳稻品系Y98149是从离子束诱变的后代中获得的显性半矮秆突变体,与野生型Y98148是1对株高近等基因系。将已经获得的3个与水稻显性半矮秆基因紧密连锁的RAPD标记分别克隆、测序,根据测序结果设计了3对特异性PCR引物,成功地将RAPD标记S1041525、S1076549和S1272403转化成更稳定的SCAR标记SCS1041498、SCS1076510和SCS1272388。通过Y98148×Y98149的F2代分离群体的分析,这3个SCAR标记与显性半矮秆基因的遗传距离分别为12.6cM、7.5 cM和16.3 cM,且位于基因的同一侧。序列同源性比较表明,标记S1272403为单拷贝,其核苷酸序列与水稻第7染色体上2个BAC克隆B1249D05(AP006451)和OJ1212-C12(AP005604)同源性为99%,B1249D05与OJ1212-C12有23 kb的重叠区域,标记S1272403位于这个重叠区域,据此初步将显性半矮秆基因定位,为进一步精确定位和图位克隆奠定了基础。
关 键 词:水稻 半矮秆突变体 显性基因 SCAR 基因定位
分 类 号:S511]
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