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期刊文章详细信息

nr数据库分析及其本地化    

Integrated nr Database in Protein Annotation System and Its Localization

  

文献类型:期刊文章

作  者:邓泱泱[1] 荔建琦[2] 吴松锋[2] 朱云平[2] 陈耀文[1] 贺福初[2]

机构地区:[1]汕头大学人工智能与模式识别实验室,汕头515063 [2]北京放射医学研究所系统生物学实验室,北京100850

出  处:《计算机工程》

基  金:国家"863"计划基金资助项目(2002-BA711A11);国家"973"计划基金资助项目(2001CB510209);北京市科技计划基金资助项目(H030230280590);国家自然科学基金委员会资助项目"创新研究群体科学基金"(321003)

年  份:2006

卷  号:32

期  号:5

起止页码:71-73

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、INSPEC、JST、RCCSE、SCOPUS、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘  要:通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问,为蛋白质注释系统整合nr数据库做好了第一步工作。

关 键 词:蛋白质序列数据库  序列比对  蛋白质注释  本地化

分 类 号:TP311]

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引证文献:

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同被引文献:

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