文献类型：期刊文章

作　　者：吴雪琼[1] 张琼[2] 张俊仙[1] 梁建琴[1] 鲁红丽[2] 李洪敏[1] 张洪恩[2] 陆阳[1] 荣利[2] 吕翠环[3] 张广宇[3] 邢婉丽[2]

机构地区：[1]解放军第309医院结核病中心研究室,北京100091 [2]生物芯片北京国家工程研究中心,北京102206 [3]河北省胸科医院,石家庄050041

出　　处：《中国防痨杂志》

基　　金："十五"国家重大科技专项"功能基因组和生物芯片"科研基金;军队医学杰出中青年人才科研基金项目(01J020)

年　　份：2006

卷　　号：28

期　　号：1

起止页码：4-10

语　　种：中文

收录情况：CAS、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型,建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR-直接测序方法为对照,应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)耐药基因(katGr、poB、rp-sLr、rs和embB)的带荧光素标记的PCR产物。结果PCR-直接测序和基因芯片检测36株结核分枝杆菌药物敏感株的5种耐药基因均为野生型。121株结核分枝杆菌耐药分离株中,56株耐INH分离株,katG基因突变率为62.5%,其中katG缺失率为7.5%,315位密码子突变率为55.4%,279位密码子突变率为1.8%;104株耐RFP株,rpoB基因突变率为94.2%,最常见的突变位点为531位和526位密码子(突变率分别为60.6%、15.4%),双位点突变率为5.8%,还发现511、513、515、516、517、518和533位密码子突变;62株耐SM分离株,rpsL和rrs总突变率为88.7%(两者分别为82.3%、6.5%),rpsL突变位于43位和88位密码子(突变率分别为77.4%、4.8%),rrs突变位于513位和516位碱基(突变分别为4.8%、1.6%);57株为耐EMB株,embB基因突变率为61.4%,均为306位密码子突变,最常见的突变为ATG→GTG或ATA(突变率分别为35.1%、15.8%),还发现306位密码子ATG→ATC、ATT和CTG突变。通过基因芯片检出的突变与基因测序结果一致。结论应用基因芯片可分析大多数结核分枝杆菌耐药基因型,弥补传统药敏试验方法的不足,指导临床治疗。

关 键 词：基因芯片 耐药基因型 聚合酶链反应 分枝杆菌 结核

分 类 号：R450]