文献类型：期刊文章

作　　者：张文[1] 唐焕文[1] 方伟武[2] 蔡旭[2] 张伟伟[1]

机构地区：[1]大连理工大学计算生物学和生物信息学研究所,辽宁大连116024 [2]中国科学院应用数学研究所,北京100080

出　　处：《大连理工大学学报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(9010303320176005)

年　　份：2005

卷　　号：45

期　　号：6

起止页码：925-930

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2004、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EI(收录号：2006069686699)、IC、INSPEC、JST、MR、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、ZMATH、核心刊

摘　　要：新近出现的信息离散性度量方法(简称FDOD方法)已在多个领域获得成功的应用,是一种非比对距离方法.随着越来越多的微生物全基因组测序任务的完成,人们开始在整个基因组水平上探讨物种的系统发育关系.因此,将FDOD方法应用于微生物系统发育分析是一项很有意义的工作.因为氨基酸序列比DNA序列更为保守,能为物种的进化分析提供更为有用的信息.对收集到的163个原核生物和5个真核生物,从完全蛋白质组出发去分析推断其系统的发育关系,所得的系统发育树包括145个细菌、18个古细菌和5个真核细菌,这与三界进化理论符合,大部分低层分支与权威的《伯杰氏系统细菌学手册》相同.并且对高层分支关系提出了一些新建议.

关 键 词：微生物 原核生物 古细菌 系统发育 信息离散性度量  

分 类 号：Q517] Q349