文献类型：期刊文章

作　　者：刘雅婷[1] 李正跃[2] 朱有勇[3] 李成云[3] 李永忠[4]

机构地区：[1]云南农业大学农学与生物技术学院,昆明650201 [2]云南农业大学植物保护学院,昆明650201 [3]云南省植物病理重点实验室,昆明650201 [4]云南农业大学烟草学院,昆明650201

出　　处：《遗传》

基　　金：国家自然科学基金项目(编号:30360061);云南省自然基金项目(编号:1999C008Z)~~

年　　份：2005

卷　　号：27

期　　号：6

起止页码：959-964

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：应用SignaIP 3.0对植物病原细菌Pseudomonas syringae pv.tomato DC3000菌株基因组中的细菌染色体全部5 615个ORFs进行了分析,确定其中679个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,其中已经命名并有注释的有107个ORFs.信号肽的长度以19～31个氨基酸居多,其中最多的是23个氨基酸的信号肽.具有信号肽的ORFs编码蛋白的长度大多为101～400个氨基酸之间.同时,对组成信号肽的氨基酸种类作了系统的分析,发现组成信号肽的氨基酸中非极性氨基酸占48.54%,极性氨基酸占18.67%,带负电荷氨基酸占24.54%,带正电荷氨基酸仅占8.00%,出现最多的3种氨基酸依次为亮氨酸、丙氨酸和丝氨酸,最少的氨基酸是异亮氨酸,在切割位点-1端的氨基酸中83.21%均为丙氨酸,在切割位点后3位的氨基酸中最多的氨基酸也是丙氨酸.通过分析确定628个分泌类信号肽,36个信号肽具有RR-motif的保守区段,15个脂蛋白类信号肽,未发现Prepiln-like信号肽和Bacteriocin and Pheromone信号肽.

关 键 词：PSEUDOMONAS SYRINGAE pv.tomato  ORF 信号肽 RR-motif  脂蛋白

分 类 号：S436.412.1]