文献类型：期刊文章

作　　者：葛佳[1,2] 谢华[1] 崔崇士[3] 洪剑明[4] 马荣才[1,2]

机构地区：[1]北京农业生物技术研究中心 [2]首都师范大学生命科学学院,北京100037 [3]东北农业大学园艺学院 [4]首都师范大学生命科学学院

出　　处：《农业生物技术学报》

基　　金：国家高技术研究与发展(863)计划课题(No.2003AA207120)资助。

年　　份：2005

卷　　号：13

期　　号：4

起止页码：423-428

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：对大白菜(BrassicacampestrisL.ssppekinensis)13007个EST序列进行拼接共得到7714个片段重叠群(contig),其中10.4%(890个)非冗余EST含有SSR标记(EST-SSR),标记间平均间隔距离为3.9kb,单、双和三核苷酸重复序列大约各占1/3左右。CDS所包含的三核苷酸重复序列最多,而且AAG/CTT重复序列的含量最高。通过同源性比较分析,获得功能已知的SSR-ESTs774个,共计含有846个SSR,其中50.2%位于5'-UTR,31.4%位于3'-UTR,18.4%位于CDS。实验选取123个SSR座位设计引物,利用芜菁花叶病毒(Turnipmosaicvirus,TuMV)的高抗和高感大白菜F6代自交系材料各2份,分析EST-SSR标记多态性。结果表明,其中37个标记可进行有效扩增,但是没有表现出多态性,23个标记(18.7%)至少在1份材料中具有多态性。对这些EST-SSR标记在大白菜和其它芸薹属植物的系统发育关系分析、遗传作图和基因定位的应用进行了讨论。

关 键 词：EST  EST-SSR 大白菜 SSR标记  标记分析  表达序列标签 EST序列 重复序列  芜菁花叶病毒 MOSAIC

分 类 号：S513] S823