文献类型：期刊文章

作　　者：金谷雷[1] 汪旭升[1] 朱军[1]

机构地区：[1]浙江大学生物信息学研究所,杭州310029

出　　处：《Acta Genetica Sinica》

基　　金：国家"863"计划(编号:2002AA234031)资助~~

年　　份：2005

卷　　号：32

期　　号：7

起止页码：726-732

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、EMBASE、IC、JST、PUBMED、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：通过隐马尔柯夫模型(HiddenMarkovModel,HMM),对粳稻(OryzasativaL.ssp.japonica)基因组的蛋白质数据库进行搜索,结果获得8个1433蛋白的同源序列,其中发现4个新基因。通过对所有粳稻的1433蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(ExpressionSequenceTags,ESTs)进一步比对,为1433蛋白找到了ESTs的证据。结果说明这些基因在水稻不同的处理和不同的部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异。蛋白质多序列联配分析结果表明,存在可能的功能多态位点。通过基因结构和染色体定位的分析,确认了水稻基因组中存在ε样和非ε样两类1433蛋白。此外,对目前植物中的1433家族作了初步的进化分析。

关 键 词：14-3-3蛋白  生物信息学分析 家族  隐马尔柯夫模型 Markov  蛋白质数据库 表达序列标签  Model  DNA序列  染色体定位 水稻基因组  同源序列  ESTs  表达模式  分析结果  多态位点 基因结构  进化分析  行搜索 sp.  新基因  粳稻  植物  

分 类 号：S511]