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期刊文章详细信息

蚊子全基因组中微卫星的丰度及其分布(英文)  ( SCI收录)  

Abundance and Distribution of Microsatellites in The Entire Mosquito Genome

  

文献类型:期刊文章

作  者:余泉友[1] 李斌[1] 李关荣[2] 房守敏[1] 颜虹[1] 童晓玲[1] 钱吉凤[1] 夏庆友[1] 鲁成[1]

机构地区:[1]西南农业大学蚕学与生物技术学院蚕桑学重点实验室,重庆400716 [2]西南农业大学农学与生命科学学院,重庆400716

出  处:《生物化学与生物物理进展》

基  金:国家自然科学基金资助项目(30300262)~~

年  份:2005

卷  号:32

期  号:5

起止页码:435-441

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCI(收录号:WOS:000229250000009)、SCI-EXPANDED(收录号:WOS:000229250000009)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:微卫星是近年大力开发的一种遗传标记,为推进按蚊遗传学相关研究,对按蚊全基因组中由1~6个碱基重复单元组成的简单序列重复(微卫星) 进行了分析. 进而对其微卫星的丰度和分布进行了比较分析,也比较了染色体各个区域(外显子、内含子和基因间隔区) 之间的分布差异. 微卫星在按蚊基因组中的比例约占2.14%,其中X染色体拥有微卫星的密度最大. 对按蚊基因组中微卫星丰度而言,A碱基和C碱基重复在基因组中丰度相似,AC单元的丰度是AG单元的两倍多,然而AT和CG单元非常稀少;对于三四碱基而言,AGC,AAAC和AAAT单元最为丰富,ACG,ACT,AGG,CCG,ATGC,CCCG,ACTG,AACT,ACGT,AGAT,CCGG,ACCT和AGCT单元等均很稀少,而一些五碱基重复,在某条甚至某几条染色体中均未分布.除两碱基重复单元在2L的外显子区域丰度较高外,其他重复单元均在内含子和基因间隔区丰富. 进一步分析显示,微卫星在每条染色体两臂的丰度和分布存在着很多的相似性.

关 键 词:微卫星 按蚊 基因组 丰度 分布  

分 类 号:Q71]

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