期刊文章详细信息
河北省马铃薯Y病毒株系分子鉴定及其RT-PCR检测
Molecular identification of Hebei potato virus Y isolate and its detection by RT-PCR
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]河北省农林科学院经济作物研究所,河北石家庄050051 [2]河北省高碑店农业局,河北保定074000 [3]河北科润农业技术有限公司,河北石家庄050051
基 金:河北省科技攻关项目(04225505)
年 份:2005
卷 号:28
期 号:3
起止页码:54-59
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:根据马铃薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)的外壳蛋白基因序列,设计合成了一对寡核苷酸引物,从感染PVY的马铃薯田间病叶组织中提取出病毒的RNA,进行cDNA合成及PCR扩增,得到一条长度约800bp的特异PCR扩增产物,与理论设计的基因片段大小一致,本试验建立了快速、灵敏、简便的PVY检测的方法。将RT-PCR扩增产物克隆到质粒pGEM-T上,并进行了序列分析。结果表明,克隆的cDNA片段由801个核苷酸组成,编码267个氨基酸组成的理论分子量为29kD蛋白,与PVY外壳蛋白的大小一致,与基因库登记的代表性株系相比,它们之间的核苷酸序列同源性为89 6%~98 8%,氨基酸序列的同源性为93 3%~98 5%,说明PVYCP基因具有高度的保守性(记为PVY-HBEI),与国内报道的PVY-CHU、PVY-ZHJ和PVY-ZHOU株系的氨基酸序列同源性分别为96 6%、98 5%和97 8%,与PVYN和PVYO株系的氨基酸序列同源性分别为93 6%和97 8%,从分子水平上确定PVY-HBEI归属于普通株系(PVYO株系)。
关 键 词:马铃薯Y病毒 反转录-聚合酶链式反应 病毒检测 外壳蛋白基因(CP) 序列分析 株系鉴定
分 类 号:S432]
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