文献类型：期刊文章

作　　者：李琳琳[1] 何雅晴[1] 朱俊萍[1] 薛颖[1] 朱雅芳[1] 徐星晔[1] 金奇[1]

机构地区：[1]中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室,北京100052

出　　处：《病毒学报》

年　　份：2005

卷　　号：21

期　　号：3

起止页码：217-222

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。

关 键 词：柯萨奇病毒A组16型 基因组  手足口病 同源性 序列分析  中国分离株 儿童  

分 类 号：R373.23] R725.1[基础医学类]