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福尔马林固定白鱀豚标本DNA提取及其遗传多样性的初步研究
DNA EXTRACTION FROM FORMALIN-FIXED TISSUES AND GENETIC DIVERSITY OF BAIJI(LIPOTES VEXILLIFER)
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国科学院水生生物研究所 [2]浙江大学濒危野生动物保护遗传与繁殖教育部重点实验室,杭州310029
基 金:国家自然科学基金(30170142);中国科学院重要创新方向项目(KSCX2-SW-118);中国科学院创新领域前沿项目(220103)资助。
年 份:2005
卷 号:29
期 号:3
起止页码:272-278
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:福尔马林固定标本是宝贵的遗传资源,但是如何有效利用其中的遗传信息一直存在问题。本文尝试从标本预处理、消化、PCR扩增各方面综合考虑和优化改进,成功提取并扩增21头福尔马林固定白豚标本线粒体DNA控制区410bp片段。采用了3种预处理方法尽量去除固定标本中残存的甲醛,从试验结果来看,从酒精梯度+临界点干燥处理的标本中提取的DNA在扩增时具有明显优势。通过蛋白酶K消化过程中对于酶的浓度、温浴时间的比较试验,发现随着采用大幅提高酶浓度、延长消化时间等高强度的蛋白酶消化操作后,DNA的质量和产量均得到显著提高。针对标本DNA降解严重的特点,设计特异性好且长度合适的引物以及使用巢式引物扩增,均提高了标本DNA扩增的特异性和灵敏度。通过对所测得的21头白鱀豚线粒体DNA控制区部分序列的对比,发现全部个体在该片段上的序列完全一致,说明白豚遗传多样性极低。
关 键 词:福尔马林固定标本 DNA提取 白暨豚 遗传多样性 极度濒危物种
分 类 号:Q959.841]
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