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期刊文章详细信息

结核分枝杆菌散在分布重复单位基因型分型法的应用研究    

Evaluation of the mycobacterial interspersed repetitive units typing as a practical approach in molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis

  

文献类型:期刊文章

作  者:沈国妙[1] 查佳[1] 徐琳[1] 孙斌[2] 桂晓红[2] 王奕峰[2] 梅建[2] 高谦[1]

机构地区:[1]复旦大学上海医学院教育部医学分子病毒学重点实验室,200032 [2]上海市疾病预防控制中心结核病防治科

出  处:《中华结核和呼吸杂志》

基  金:国家科委973基因资助项目(2002CB512804);上海市卫生局基因资助项目(034027)

年  份:2005

卷  号:28

期  号:5

起止页码:292-296

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的建立结核分枝杆菌散在分布重复单位(mycobacterialinterspersedrepetitiveunits,MIRU)基因型分型法,评估该方法在我国应用的可行性。方法采用简单数字表法随机抽取上海地区2000年至2002年保存的菌株,对其进行MIRU分型,并与间隔区寡核苷酸分型法(Spoligotyping)的结果进行比较。结果用Spoligotyping方法对随机抽样的91株临床菌株进行基因型分型,得到20种基因型,其中81株(89%)属于北京基因型菌株,而用MIRU分型方法可将这些菌株分为46种基因型。81株北京基因型菌株可以分为39种不同的MIRU基因型。12个MIRU位点的多态性分析表明各位点有较大的区别,其中位点26显示了较高的多态性,位点16、31、40显示了中等程度的多态性。结论MIRU分型方法简单快速,其数字化结果清晰可靠,是一种有效的结核分枝杆菌基因型分型方法。

关 键 词:结核分枝杆菌  分型法 SPOLIGOTYPING 分布  分型方法 2002年  2000年  基因型分型 多态性分析  上海地区  寡核苷酸  临床菌株 随机抽样  位点  数字表 间隔区  数字化  北京  显示  

分 类 号:R446.5]

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