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利用正交设计优化水曲柳ISSR-PCR反应体系
Optimization for ISSR-PCR System of Fraxinus mandshurica Rupr.Using Orthogonal Design
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]东北林业大学林学院,哈尔滨150040 [2]黑龙江省林业科学院,哈尔滨150040
基 金:国家十五攻关课题,北方主要珍贵阔叶用材树种优良品种选育及培育技术——子课题水曲柳良种选育技术(2002BA515B0502)基金项目资助。
年 份:2005
卷 号:3
期 号:3
起止页码:445-450
语 种:中文
收录情况:CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:利用正交设计L16(45)对水曲柳ISSR-PCR反应体系的5因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP,引物)在4个水平上进行优化试验,PCR结果用统计软件MINITAB分析:①各因素的不同水平对PCR反应结果都有显著的影响,其中Taq酶量影响最大;②筛选出各反应因素的最佳水平,建立水曲柳ISSR-PCR反应的最佳体系(20滋l)为:Taq酶1.0U,Mg2+2.0mmol/L,模板DNA50 ̄200ng,dNTP0.15mmol/L,引物0.3滋mol/L。最后,对水曲柳ISSR-PCR最佳反应体系进行梯度退火,得到最佳退火温度为58.3℃。这一优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术,研究水曲柳的地理变异提供一个标准化程序。
关 键 词:PCR反应体系 水曲柳 设计优化 ISSR-PCR ISSR标记技术 MINITAB MG^2+ Taq酶 最佳反应体系 模板DNA 标准化程序 正交设计 DNTP 优化试验 统计软件 退火温度 优化系统 地理变异 水平 mol 引物 果用
分 类 号:S792.41]
参考文献:
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