文献类型：期刊文章

作　　者：闫双勇[1] 谭振波[2] 刘学军[1] 苏京平[1] 马忠友[1] 孙林静[1] 卢百关[3]

机构地区：[1]天津农作物研究所,天津300112 [2]北京大北农农业科技研究院,北京100085 [3]连云港市农科院,连云港222003

出　　处：《分子植物育种》

年　　份：2005

卷　　号：3

期　　号：3

起止页码：335-341

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：抽穗期是水稻的一种重要农艺性状,但其遗传控制机理还不清楚。本文利用数据库搜索的方法,搜索并分析了30个与拟南芥光周期调控途径花期控制基因同源的水稻基因。利用水稻多态性数据库,得到了发生在这些基因以及Hd6、Ehd1、OsSOC1上的820个SNP及191个InDel位点。分析表明,这些位点不是平均分布到每个基因上。SNP/InDel含量较高的基因存在SNP/InDel的热点片段。14.1%的SNP位点,及7%的InDel位点分布在基因的编码区。本文也分析了侯选基因侧翼5Kb范围内的SNP/InDel多态性位点。按照侧翼多态性位点数目的分布可以将侯选基因分成4种类型,即两侧保守型、两侧热点型、单侧热点型、一侧热点一侧保守型。

关 键 词：SNP 抽穗期 多态性分析 候选基因 侯选基因  数据库搜索 多态性位点  农艺性状  控制机理  水稻基因  控制基因 调控途径  热点  光周期  拟南芥  820  分析表  分布  编码区  遗传  花期  

分 类 号：S511] Q75]