期刊文章详细信息
SSH法结合定量PCR技术研究双肌臀猪肌肉组织的差异表达基因 ( SCI收录)
Isolation of Differentially Expressed Genes in Double-muscling Large White Pig by SSH and Q-PCR Strategy
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国农业大学动物科技学院农业生物技术国家重点实验室,北京100094
基 金:国家重点基础研究发展规划项目(973) (TG2000016104);国家杰出青年基金资助项目(39725022)~~
年 份:2005
卷 号:32
期 号:4
起止页码:353-358
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCI(收录号:WOS:000228316600011)、SCI-EXPANDED(收录号:WOS:000228316600011)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:利用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH) 成功地构建了双肌臀与非双肌臀大白猪肌肉组织差异表达的消减cDNA文库,获得有效克隆686个. 对整个文库测序分析,共获得587条有效序列. 利用BLAST在线软件与GenBank、GenBank EST和Tigr Porcine EST等数据库进行同源序列比较,发现其中有11个未知新序列,可能代表“双肌臀”大白猪肌肉组织特异表达的新基因. 对文库中所包含的兰尼啶受体基因(RYR1) 、钙依赖性蛋白激酶基因(CAMK2)、人类胰岛素生长因子结合蛋白-7 基因(IGFBP7),以及695号、882号和480号3个新基因进行了实时荧光定量PCR检测,结果显示:RYR1、CAMK2及IGFBP7基因在双肌臀猪肌肉组织RNA池中的表达量,分别为对照的非双肌臀猪肌肉组织RNA池中表达量的1.87、1.90和1.85倍;695号、882号和480号3个新的ESTs在双肌臀猪肌肉组织RNA池中的表达量为非双肌臀猪肌肉组织RNA池中表达量的1.48、1.44和1.78倍. 这提示我们,上述基因的上调表达很可能与猪双肌臀性状的发生有密切的关系,可以作为研究该性状的候选基因.
关 键 词:双肌臀大白猪 抑制性消减杂交 基因差异表达 荧光定量PCR
分 类 号:Q7]
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