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磁珠富集法与小片段克隆法筛选鲤微卫星的比较研究
Comparison between magnetic beads enriched and small inserted fragment library for microsatellite sequences of common carp
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070
基 金:国家"863"高技术研究发展项目(863-101-05-02-01).
年 份:2005
卷 号:12
期 号:2
起止页码:126-132
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:用2种方法克隆黑龙江鲤(Cyprinus(Cyprinus)carpiohaematopterus)的微卫星序列。这2种方法分别是:①经典的小片段DNA克隆库,用末端标记的[γ-32]ATP的CA重复序列为探针筛选;②将酶切获得的小片段DNA用结合有磁珠的并连接有15个CA重复序列的生物素进行富集,获得的含有CA重复的DNA片段并经过两次PCR扩增再克隆的方法获得富集微卫星片段的克隆库。从前一个方法的克隆库中筛选2000个菌落,获得阳性克隆45个,有22个含有微卫星,完美型的占63 6%,非完美型的占22 7%,混合型的占13 7%,重复次数超过10的有9个,占40 9%;从方法②的克隆库中筛选2600个菌落,获得阳性克隆1300个,测序其中的390个克隆,微卫星314个,完美型的占79 0%;非完美型的占14 3%;混合型的占6 7%,重复次数超过10的有293个,占93 3%。结果表明,用生物素结合磁珠富集法克隆微卫星效率高,成本低,所获微卫星质量高,是一种值得推荐的微卫星制备方法。
关 键 词:磁珠富集 小片段克隆 鲤 微卫星
分 类 号:Q959.468]
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