文献类型：期刊文章

作　　者：孙浩[1] 杜奇石[1] 王树青[1] 谢军民[1] 李大鹏[1]

机构地区：[1]天津师范大学生物信息与药物开发研究所,天津300074

出　　处：《湘潭大学自然科学学报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目 (2 0 3730 48) ;天津市科委基础科学重点项目 (0 3380 1 91 1 )

年　　份：2004

卷　　号：26

期　　号：4

起止页码：80-84

语　　种：中文

收录情况：AJ、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、MR、SCOPUS、ZGKJHX、ZMATH、普通刊

摘　　要：用新近发展的冠状病毒的基因解析软件系统ZCURVE -CoV 1 .0和ZCURVE -CoV 2 .0(http ://tubic .tju .edu .cn/sars/)分析了基因库 (NCBIRefSeqproject)中的 2 7个不同来源的SARS冠状病毒的RNA基因序列 ,找出了主蛋白酶 (CoVMpro)在聚蛋白pp1a和pp1ab中的 2 97个酶切位点 .在此基础上确定的 1 1个SARS冠状病毒主蛋白酶的可切割八肽 .这些八肽都含有SARSCoVMpro 的真实切割点 ,因而是发展SARSCoVMpro的多肽类抑制剂的适宜出发点 .计算了可切割八肽在特异性位点R2、R1、和R1上的氨基酸的分布概率 ,发现位点R4和R3也有一定的特异性 .分析了这些位点上的氨基酸的结构特征 ,找出了最有希望成为SARSCoVMpro的多肽类抑制剂的两个八肽NH2 -ATLQ↓AIAS-COOH和NH2 -ATLQ↓AENV -COOH ,并探讨了对可切割八肽作化学修饰的思路 ,为SARSCoVMpro的多肽类抑制剂和非肽类抑制剂的设计提供了基础 .同时把生物信息学用于药物开发 。

关 键 词：SARS SARS冠状病毒主蛋白酶  多肽的剪切性  抑制剂 变形钥匙  

分 类 号：Q51] Q516