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太平洋牡蛎中诺瓦克样病毒的RT-PCR法检测和病毒聚合酶区部分序列的分析
Detection of Norwalk -like viruses in oysters by RT - PCR and gene sequence anal-ysis of RNA polymerase fragments
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国海洋大学食品安全实验室,山东青岛266003 [2]宁波大学食品与科学研究所,浙江宁波315211
基 金:宁波市博士科学基金.
年 份:2004
卷 号:11
期 号:6
起止页码:525-530
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:利用pH9.5的甘氨酸缓冲液性处理太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)匀浆液,PEG沉淀病毒粒子的方法对未知的是否污染有诺瓦克样病毒(Norwalk-like Virus,NLVs)的牡蛎样品进行处理,并提取病毒RNA,进行RT-PCR,凝胶电泳检测扩增结果。初步建立了牡蛎中NVLs的检测方法。纯化所得的特异PCR产物,克隆到T-载体中,筛选转化子,提取质粒,并进行PCR电泳鉴定。重组质粒序列测定结果在NCBI上进行BLASTn显示所得产物与已发表的诺瓦克样病毒的相应序列具有极高的同源性(>95%);根据Genebee在线分析系统AliBee-Multiple Alignment进行对中国的诺瓦克样病毒粪便分离株和牡蛎分离株的扩增序列进行相似性分析,结果从我国养殖的牡蛎样品中和胃肠炎病人粪便中分离出2个的诺瓦克样病毒之间无显著的差异。
关 键 词:太平洋牡蛎 诺瓦克样病毒 反转录PCR 核酸序列
分 类 号:Q959.215]
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