文献类型：期刊文章

作　　者：李斌[1] 夏庆友[1] 鲁成[1] 周泽扬[1]

机构地区：[1]西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点实验室,重庆400716

出　　处：《Acta Genetica Sinica》

基　　金：国家自然科学基金 (批准号 :3 0 3 0 0 2 62 )资助~~

年　　份：2004

卷　　号：31

期　　号：10

起止页码：1089-1094

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、EMBASE、IC、JST、PUBMED、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：为加速分子标记在蜜蜂遗传、进化与行为等方面的利用 ,分析了简单重复序列 (SimpleSequenceRepeats,SSRs)在蜜蜂EST中的分布频率与密度。所分析的蜜蜂EST数据集包含 15 86 9条序列 ,总长为 7 9Mb。结果显示 ,蜜蜂ESTs中SSRs的频率为 1/ 0 5 2kb ,其中 6碱基重复基序占总SSRs的 4 5 0 % ,是最丰富的重复单元 ,而 2、1、3、4与 5碱基重复基序分别占总SSRs的 17 9%、14 1%、11 6 %、9 2 %和 2 2 %。同时 ,在各种SSRs重复单元中 ,富含A碱基的重复单元占据优势地位 ,如 :A、AT、AG、AC、AAT、AAG、AAC、AAAT、AAAG、AAAAG、AAAAT、AATAT、AAAAAG和AAAAAT重复基序 ,而富含G碱基的重复单元在基因编码区中含量较低。进一步分析显示 :蜜蜂SSRs在冗余与非冗余EST数据集中的分布频率与密度相似 ,仅存在极小的偏差 。

关 键 词：蜜蜂 EST 微卫星 SSR

分 类 号：S891]