文献类型：期刊文章

作　　者：彭涛[1] 温博海[2] 蹇锐[1] 钟敏[3]

机构地区：[1]第三军医大学微生物教研室,重庆400038 [2]军事医学科学院微生物流行病研究所,北京100071 [3]重庆市肺科医院

出　　处：《中国人兽共患病杂志》

基　　金：重庆市科委攻关项目 (2 0 0 0 -63 0 9)

年　　份：2004

卷　　号：20

期　　号：9

起止页码：772-776

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2000、CSCD、CSCD2011_2012、IC、PROQUEST、WOS、核心刊

摘　　要：目的　建立分支杆菌的 16SrDNA序列分析的方法 ,采用该方法鉴定临床结核分支杆菌分离株。方法　用PCR从重庆某医院的肺部感染病人的痰标本中分得的 2 9株分支杆菌菌株中扩增 16SrRNA基因 (16SrDNA)的 5′端片段 (～5 0 0bp) ,并测定所得到片段的DNA序列。用DNA分析软件将所获得的序列与GenBank的分支杆菌序列相比较 ,计算种间相似性 ,并用序列构建分支杆菌菌株的系统发育树 ,对分离株进行分类与鉴定。结果　有 14株的 16SrDNA序列分别与已知结核分支杆菌复合群 (Mycobacteriatuberculosiscomplex ,MTC)、戈登分支杆菌、新金色分支杆菌、氯酚红分支杆菌、龟分支杆菌或脓肿分支杆菌的序列完全相同。依据完全一致的序列可以准确鉴定这些临床分离株为相应的种 ;部分分离株的 16SrDNA在GenBank序列检索中无完全一致的匹配序列。用临床分离株的 16SrDNA序列与已知的分支杆菌 16SrDNA序列构建的系统发育树 ,结果提示某些菌株可能是与已知分支杆菌密切相关的新种或是它们的亚种。结论　 16SrDNA序列分析鉴定分支杆菌是一种快速、可靠、成本较低的方法 ;

关 键 词：分支杆菌 菌株鉴定 PCR  16SrRNA  DNA序列

分 类 号：R378.91]