文献类型：期刊文章

作　　者：王忠良[1,2] 丁燏[1,3] 许尤厚[4] 简纪常[1,3] 鲁义善[1,3] 王蓓[1,3] 陈刚[1,2] 吴灶和[3,5]

机构地区：[1]广东海洋大学水产学院,湛江524088 [2]广东海洋大学南海水产经济动物增养殖重点实验室,湛江524088 [3]广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,湛江524088 [4]广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室(钦州学院),钦州535000 [5]仲恺农业工程学院,广州510225

出　　处：《海洋与湖沼》

基　　金：国家自然科学基金项目;31202023号;广东海洋大学优秀青年骨干教师特别资助计划;2014001号;广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室(钦州学院)开放课题;2015KB05号

年　　份：2015

卷　　号：46

期　　号：3

起止页码：687-693

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：为获得稳定可靠的马氏珠母贝SSR分子标记,本文利用MISA软件对转录组测序数据进行了大规模的EST-SSR标记发掘,并分析了位点信息及其多态性。结果表明,马氏珠母贝转录组测序所获得的74007条Unigenes中检测出9872个EST-SSR位点,位点出现频率为13.34%,平均每5102 bp含有1个SSR位点。在转录组SSR中共有132种重复基元类型,其中单核苷酸重复基元为主要类型,占SSR总数的81.46%;单核苷酸重复以A/T基序为主,占SSR总数的71.27%。基于筛选的SSR序列,应用Primer3软件进行引物的批量设计,共为5922条EST-SSR序列成功设计出17766对引物。随机选择80对引物对EST-SSR多态性进行检测,共有62对引物成功扩增出稳定条带,占引物总数的77.5%;其中,17对EST-SSR引物表现出个体多态性,多态性比率为27.42%。以上研究为马氏珠母贝遗传多样性、遗传图谱构建及分子辅助育种研究提供了有效工具,对于马氏珠母贝种质资源保护、优良品种培育和珍珠养殖业的健康发展均具有重要意义。

关 键 词：马氏珠母贝 简单重复序列 转录组 分子标记

分 类 号：S917.4[水产类]