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四川部分地区猪流行性腹泻的分子流行病学调查
Molecular epidemiological investigation porcine epidemic diarrhea in some areas of Sichuan
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]四川农业大学动物医学学院动物传染病与基因芯片实验室,四川雅安625014 [2]四川农业大学人兽共患病研究室与猪病防治研究中心,四川成都611130
基 金:国家自然科学基金资助项目(31072144);国家公益性行业(农业)科研专项基金资助项目(20123056)
年 份:2015
卷 号:35
期 号:5
起止页码:704-710
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、JST、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:本研究对四川猪流行性腹泻病毒(PEDV)开展了分子流行病学调查。参照毒株CV777的M基因序列,设计1对特异性引物(预期扩增大小为392bp),建立了快速检测PEDV的RT-PCR技术,对四川9个地区规模化猪场的75份仔猪腹泻病料进行检测与分析。再根据S基因的变异区域设计1对引物(扩增大小为947bp),选择扩增了四川9个地区的代表样品的S基因序列,并进行了进化与变异分析。结果显示,建立了检测PEDV的M基因的RT-PCR技术,并确定了最佳反应条件和反应体系,用该方法检测了四川75份腹泻病料,检出64份PEDV阳性,PEDV阳性检出率为86.67%,结果显示PEDV在四川地区发病季节除冬春季外,近年夏季也呈高发趋势。四川9株PEDV的S基因的核苷酸同源性为95.9%~100%,氨基酸同源性为95.1%~100%,四川毒株与14个国内外参考毒株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为84.6%~99.5%和84.2%~99.5%;四川流行毒株的S基因(S蛋白)存在碱基(氨基酸)缺失和插入现象。结果表明,本研究从分子流行病学角度证实了四川部分地区PEDV的流行与变异情况,为指导该地区PEDV科学防控提供了依据。
关 键 词:猪流行性腹泻 M基因 RT-PCR M基因 分子流行病学 序列分析
分 类 号:S858.28]
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