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甘蔗基因表达定量PCR分析中内参基因的选择
Selection of Control Genes in Real-time qPCR Analysis of Gene Expression in Sugarcane
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室,福州350002
基 金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(No2007AA100701);农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(No2006-G37);福建省科技厅国家科技项目备案(NoF2007AA100701);现代农业产业技术体系建设专项资金资助
年 份:2009
卷 号:30
期 号:3
起止页码:274-278
语 种:中文
收录情况:CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:以甘蔗接种黑穗病菌后0、6、12、24、48、60和72h时间点的材料为研究对象,应用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,Real-timeqPCR)技术,探讨25SrRNA、GAPDH、β-actin和β-tubulin4个内参基因mRNA水平的表达情况。经geNorm程序统计学分析,4种内参基因的表达稳定性各异,25SrRNA>GAPDH>β-actin>β-tubulin,其中以25SrRNA表达稳定性最好,且根据该基因设计的两对定量PCR引物都是可行的。同时,甘蔗PPO基因表达特性的定量PCR分析也显示,甘蔗PPO基因与植物的抗病性相关。结果显示,研究中所筛选的内参基因是合适的。
关 键 词:内参基因 geNorm程序 基因表达 实时定量PCR 多酚氧化酶基因
分 类 号:S566.1]
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