文献类型：期刊文章

作　　者：何伟[1] 张同武[1] 林毅[1]

机构地区：[1]华侨大学生物工程与技术系工业生物技术福建省高校重点实验室,福建泉州362021

出　　处：《计算机与应用化学》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(40601046);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划基金资助;福建省自然科学基金资助项目(B0510011).

年　　份：2009

卷　　号：26

期　　号：3

起止页码：279-282

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：通过同源建模获得抗癌晶体蛋白Parasporin-3的初始三维结构,利用分子动力学方法优化之。分析模建分子的结构,最后利用Ramachandran plot,结构匹配等方法评价模型。结果显示Parasporin-3蛋白模型分子具有3个结构域,与经典的杀虫晶体蛋白结构相似,蛋白模型分子中的键长、键角以及二面角的分布合理,与模版蛋白的主链α碳原子的均方根差RMSD值为0.486751,在合理范围之内,表明Parasporin-3蛋白模型良好。并对Ⅲ型抗癌晶体蛋白的两种蛋白的预测结构进行了比较。为抗癌晶体蛋白的抗癌的分子机制及其定向改造提供信息。

关 键 词：抗癌晶体蛋白 空间结构 同源建模 分子动力学模拟

分 类 号：Q93]